1.假定Windows CE.NET目标工程目录为D:\WINCE420\PUBLIC\MyWinCE，并且工程已经Build成功，假定Windows CE.NET的应用程序为MyApp.exe；
2.将MyApp.exe复制到D:\WINCE420\PUBLIC\MyWinCE\SAMSUNG_SMDK2410_ARMV4Release目录下；
3.修改MyWinCE工程的project.bib文件，在FILES Section添加如下内容：
MyApp.exe $(_FLATRELEASEDIR)\MyApp.exe NK H
4.创建快捷方式文件MyApp.lnk，文件内容如下：
10#\Windows\MyApp.exe
MyApp.lnk文件也放入D:\WINCE420\PUBLIC\MyWinCE\SAMSUNG_SMDK2410_ARMV4Release目录下；
5.修改MyWinCE工程的project.bib文件，在FILES Section添加如下内容：
MyApp.lnk $(_FLATRELEASEDIR)\MyApp.lnk NK H
6.修改MyWinCE工程的project.dat文件，添加如下内容：
Directory("\Windows\Startup"):-File("MyApp.lnk","\Windows\MyApp.lnk")
7.修改MyWinCE工程的platform.bib文件，在FILES Section添加如下内容：
MyApp.exe$(_FLATRELEASEDIR)\MyApp.exeNKH
MyApp.lnk$(_FLATRELEASEDIR)\MyApp.lnkNKH
8.Platform. Builder IDE：【Build】->【Make Image】（记得千万不要Build或者Rebuild）
9.成功后，得到的NK.bin（或NK.nb0）就包含了应用程序MyApp.exe和MyApp.lnk，当把相应的内核烧入开发板MyApp程序就会在系统启动时自动运行。
    虽然MyApp可以自己启动了，但每次启动的时候，总是微软的桌面先出来，再启动我们的程序，感觉还是不伦不类。对此，我们可以使用startup的快捷方式再加上隐藏任务栏的方法，效果非常的好，具体操作是：
1)首先新建工程，把你的应用程序放到内核里面去（前面介绍了如何做）；
2)编译平台；
3)修改shell.reg的文件：在文件中有这样一行：
[HKEY_LOCAL_MACHINE\init]
"Launch50"="explorer.exe"
"Depend50"=hex:14,00, 1e,00
把这个explorer.exe改成你的应用程序（比如：MyApp.exe）就可以了；
4)Platform. Builder IDE：【Build】->【Make Image】（记得千万不要Build或者Rebuild）
5)成功后，得到的NK.bin（或NK.nb0）就包含了应用程序MyApp.exe和MyApp.lnk，当把相应的内核烧入开发板MyApp程序就会在系统启动时自动运行。